El Instituto de Química Física de los Materiales, Medio Ambiente y Energía (INQUIMAE) se creó como Instituto de la Universidad de Buenos Aires en 1992 (desde su creación el Director fue el Dr. Roberto Fernández Prini y el Vicedirector el Dr. José Antonio Olabe) recibiendo una importante donación de la Deutsche Gesellschaft für Technische Zusammenarbeit (GTZ) de Alemania para el apoyo de la química en el área de Buenos Aires. Desde 1995 INQUIMAE forma parte del CONICET y en marzo de 1999 se constituyó en Unidad Ejecutora. A partir del Convenio UBA-CONICET en 2005 pasó a ser un instituto de doble dependencia.

En mayo de 2008 se hizo cargo de la Dirección el Dr. Ernesto J. Calvo por concurso público de ambas instituciones hasta 2013 en que se concursó nuevamente el cargo. La UBA y el CONICET designaron al Dr. Ernesto J. Calvo por concurso público por otro período de 5 años como Director de INQUIMAE. El Dr. Fernando Battaglini ha sido designado  Vicedirector.

Integran INQUIMAE 40 investigadores de la carrera del investigador (CIC), 34 becarios doctorales y posdoctorales y 11 miembros de la carrera de personal de Apoyo de CONICET (CPA). Además, cuenta con 4 investigadores y 2 administrativos de la UBA. Hay actualmente 11 estudiantes doctorales con becas de UBA, 8 de la ANPCyT y 15 becarios doctorales y posdoctorales de otras instituciones, incluyendo becarios de países latinoamericanos. Investigadores visitantes y becarios del Interior, Latinoamérica, Europa y los Estados Unidos participan de proyectos de colaboración.